Estupendas presentaciones online con software libre

Ha pasado ya tiempo desde que escribí un tutorial de Compartir la riqueza – STW, así que ya es hora de compartir algunos conocimientos prácticos (aunque sean básicos) más allá de la publicación de un enlace.

Durante años he tenido un proyecto en la lista “por hacer”: crear presentaciones sin la necesidad de software dedicado, sea privativo (como PowerPoint o Keynote), o libre (como LibreOffice u OpenOffice). De esa manera podría evitar traer mi computadora a una conferencia, y no preocuparme acerca de qué sistema informático estará disponible en el auditorio. Mientras haya conexión a Internet o un puerto USB, puedo llevar una URL y un USB como copia de seguridad, y funcionará.

También quería una funcionalidad mínima como:

    • Ser capaz de imprimir la presentación o exportarla a PDF
    • Controles de teclado (incluida vista resumen)
    • Barra de progreso
    • Se ajusta a cualquier dispositivo
    • Transiciones y efectos
    • Reproducible en cualquier navegador sin la necesidad de ningún plug-in o software adicional
    • Ventana del presentador con la siguiente diapositiva, notas y cuenta atrás
    • Todo en un formato de archivo fácil de usar, como HTML o Markdown

Por supuesto, tus deseos serán atendidos por los dioses del Software Libre. He aquí la librería JavaScript sin dependencias Reveal.js .Pero para hacer la presentación realmente impresionante, había algunas cosas más que necesitaba hacer, como incorporarla en mi flujo de trabajo de Git (para tener las ramas, versiones y todas esas ventajas git) y hospedarlo.

Déjame guiarte por el proceso, para que también puedas preparar presentation alucinantes en muy poco tiempo:

Primero, crea un nuevo repositorio en GitHub o GitLab (si no sabes lo que es, primero debes leer otros tutoriales). Para este tutorial, utilizaré GitHub, aunque en la oficina utilizamos Gitlab.

Da a tu presentación un nombre, como “MyPresentation”.

Clónala en tu máquina local. Puedes utilizar la aplicación GUI (me gusta la nueva versión beta basada en Electron) o utilizar el CLI (“Terminal” para usuarios de Apple OSX):

git clone git@github.com: yourusername/MyPresentation.git
[Nota obvia: sustituye “yourusername” por tu nombre de usuario]

Clona reveal.js en tu máquina local. Esta vez:
git clon git@github.com: hakimel/reveal.js.git

Ve al sistema de archivos (“Finder” en OSX), busca tu directorio (“Carpeta” en OSX) de trabajo Git y mueve (o copia) el contenido del directorio “reveal.js” a la carpeta “MyPresentation”.

Modifica el archivo index.html. Aquí es donde va tu contenido de presentación y formato. Echa un vistazo al este detallado tutorial .

Una vez hecho esto, “sube” el proyecto modificado a tu Git. Si utilizas la CLI:
git push

Si quieres usa Grunt para servir dinámicamente en local. Algunas personas incluso utilizan generator-reveal, un generador Yeoman, para que cada diapositiva sea un archivo HTML o Markdown individual.

Si estás utilizando GitHub, ahora, “automágicamente”, tus diapositivas se publican en yourusername.github.io/MyPresentation

Un detalle más: si deseas acceder a los diapositivas en sí (para una presentación remota o alojada) en lugar del “repo” (repositorio de todos los archivos que acabas de “subir”), tienes que ir a GitHub y activar “GitHub pages” en este repositorio en particular. Simplemente ve a la página index.html del repositorio en GitHub y selecciona el ícono de menú de flecha abajo en la parte superior derecha (junto a “insights”) “settings > pages” y activa las páginas de GitHub para ese repo.

Además, hay muchos plug-ins que puedes usar con reveal.js, como kreator . ¡A disfrutar!

Invitado a participar en evento de tecnología China – Reino Unido

Por razones que no vienen a cuento de este post, me invitaron a participar en el evento UK-China Hi! Technology en Londres.

El evento fue muy concurrido por un gran número de empresarios, fondos e inversores del Reino Unido y China.

El punto culminante del evento, para mí, aparte de un par de contactos realmente interesantes, fue ver a todos estos ejecutivos trajeados haciendo cola para probar los equipos de VR (HTC, Oculus, Hololens, etc). El claro ganador fue Robot Recall para la plataforma Oculus.

En mi tiempo libre: análisis estructural de mutaciones protéicas causantes de enfermedades congénitas

La mayoría de la gente que conozco no consideraría el análisis estructural de mutaciones protéicas causantes de enfermedades congénitas “diversión del tiempo libre”. Por otra parte, la mayoría de la gente que conozco no piensa que soy como la mayoría de la gente que conocen.

Esta semana soy un “padre soltero”, ya que mi esposa está de viaje. Con lo que mi tiempo libre ahora es casi inexistente. Sin embargo, la idea de transformar una Prolina en una Glicina en la posición 22 me intrigó, así que pasé unos minutos simulándolo. Esto es lo que descubrí:

Método

La estructura 3D de mi proteína objetivo la obtuve de la base de datos UniProt empleando Reprof. La información estructural la obtuve del análisis de PDB: 3NIR. Las anotaciones las obtuuve de UniProt CRAM_CRAAB.

Amino Ácidos

Me interesaba la mutación de una Prolina en una Glicina en la posición 22.

La figura más abajo muestra la estructura esquemática del amino ácido original (izquierda) y mutante (derecha). El esqueleto, que es el mismo para cada amino ácido, se muestra de color rojo. La cadena lateral, única para cada amino ácido, de color negro.

 muta a 

Cada amino ácido tiene su propio tamaño, carga, y valor de hidrofobicidad. El resíduo original y el mutante difieren en dichas propiedades: el resíduo mutante es más pequeño que el original, mientras que el original es más hidrofóbico que el mutante.

Variantes

Existe una mutación conocida a “S” en dicha posición, que difiere de la mutación que yo había simulado. El efecto de dicha variante está anotada como: In isoform SI.

Conservación

El resíduo original no se conserva en esta posición. Otro tipo de resíduo se observa más a menudo en esta posición en otras secuencias homólogas. Esto significa que otras proteínas homólogas existen con ese otro tipo de resíduo más que con el original de mi secuencia, pero el otro tipo de resíduo no es similar a mi mutación. Por lo tanto la mutación es probablemente patogénica.

Dominios

Este resíduo es parte de un dominio de interpro llamado: Thionin IPR001010

El resíduo mutado está ubicado en la superficie de un dominio sin función conocida. El resíduo no parece estar en contacto con otros dominios con función conocida en la estructura definida. No obstante, el contacto con otras moléculas o dominios es posible y puede ser afectado por esta mutación.

Propiedades de Amino Ácido

El amino ácido original y el mutante difieren en tamaño. El resíduo mutante es más pequeño que el original. Esto causará una posible pérdida de interacciones externas.

La hidrofobia del original y el mutante también difieren. La mutación puede causar pérdida de interacciones hidrofóbicas con otras moléculas en la superficie de la proteína.

Imágenes

Vista general de la proteína en forma de diagrama de Richardson. La proteína está coloreada por elemento; α-hélice=azul, β-filamento = rojo, giro=verde, y bobina aleatoria=cián.

Aquí la proteína está coloreada en gris, la cadena lateral del resíduo mutado está coloreada magenta y se muestra como pequeñas bolas.

Vista cercana de la mutación. La proteína está coloreada gris, ambas cadenas (original y mutada) se muestran en verde y rojo respectivamente.

Desde un ángulo diferente.

Desde otro ángulo

Animado

Animación rotatoria con mismo esquema de colores.

Animación con mismo esquema de colores.

Cita

Protein structure analysis of mutations causing inheritable diseases. DOI: 10.1186/1471-2105-11-548. PubMed: 21059217.

Visitando el Museo de Diseño de Londres

Ayer visité con mi hijo el Museo del Diseño (“El principal museo del mundo dedicado al diseño contemporáneo en todas las formas, desde la arquitectura y la moda hasta el diseño gráfico, producto y diseño industrial”) en su espectacular nueva ubicación en High Street Kensington (Londres).

El #newdesignmuseum abrió sus puertas en su nueva ubicación hace sólo 5 días. El edificio y la renovación son geniales, y en una buena ubicación: al borde de Holland Park, con la ventaja de estar cerca del jardín de Kioto, Muji, y no lejos de la Serpentine Gallery.

Esperaba más de la(s) tienda(s) y sentí que a las exposiciones le faltaba un curating más atrevido, y una comunicación más atractiva. Aunque el tema de “Diseñador, Creador, Usuario” no estaba mal, pero podrían haber ahondado definitivamente más en el concepto.

Además, considero que la colección no era lo suficientemente amplia, con una abrumadora mayoría de dispositivos electrónicos de consumo, y no lo suficiente de otras disciplinas como moda, arquitectura o incluso fabricación industrial.

En general, una agradable noche en un bonito museo, pero con mucho espacio para mejorar.

Mi empresa ha sido nombrada “Top Scaleup en el Reino Unido”

Por segundo año consecutivo, mi empresa ha sido nombrada “Top Scaleup en el Reino Unido”. Esto significa que estamos creciendo rápidamente, y también que me invitan a eventos muy chulos. Uno de esos eventos fue una recepción y una serie de charlas “Dentro de diez años” en la Royal Institution, otro una sesión de tutoría en el Ayuntamiento de Londres, y otro una serie de charlas en Google Campus. Algunas de las personas que conocí en esos eventos:

  • Brian Forda, Profesor de Cripto Monedas, MIT
  • Maria Contreras-Sweet, Directora, USA Small Business Administration
  • Megan Smith, US CTO, White House Office of Science and Technology Policy
  • Obi Felten, Directora, Google X

Microsoft Future Decoded 2016

El 1 de noviembre asistí a Future Decoded, el evento anual en el que Microsoft y sus partners presentan sus productos y conceptos de futuro.

Además de algunas “atracciones de feria” (como el Delorean de Regreso al Futuro, ver cómo los datos no se eliminan por completo, incluso si se congela un disco duro, el cohce que bate records de velocidad Bloodhound, o el interior de una turbina de Rolls Royce), la clave para mí fue poder demostrar el software de mi empresa funciondo en un increíble Microsoft Surface Hub de 84″, y asistir a la fiesta sólo-por-invitación de ejecutivos de Microsoft en el Hotel Sunborn Yacht.

Conferencia Medicina Exponencial San Diego día 4

El martes 11 de octubre fue el cuarto y último día de la Conferencia Medicina Exponencial en San Diego.

Algunas de las charlas que más disfruté:

Pensamiento Exponencial y Predicciones Futuras: Ray Kurzweil Co-founder & Chancellor, Singularity University

Emprendedurismo Exponencial:

  • Zayna Khayat, PhD Lead, MaRS Health and Director, MaRS EXCITE
  • Stephanie Marrus, MBA Entrepreneurship Center Director, UCSF

Invertiendo en el Futuro: Vinod Khosla Founder, Khosla Ventures

Visualizando el Futuro de la Educación Médica, de VR al quirófano:

  • Stefano Bini, MD Professor of Orthopedics, UCSF
  • Stephen Swensen Medical Director- Leadership and Organization Development, Mayo Clinic

Síntesis- De la Imaginación a la Innovación al Impacto
Kevin Wildenhaus, PhD Behavioral Science Lead: Janssen Disease Interception Accelerator, Johnson & Johnson

Y justo tras eso me fui al aeropuerto.

Aquí puedes ver más fotos del evento.

Té con Peter Diamandis y cena con Vinod Khosla

El lunes, 10 de octubre, tuve el placer de charlar con Peter Diamandis en una pausa de café (té para mí, gracias).

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Se mostró muy interesado en hablar de mi empresa (Kanteron Systems), ya que hemos desarrollado tecnología que puede ayudar a algunas de sus inversiones en Medicina de Precisión y Longevidad.

Aún más interesante que hablar de inversiones, fue conocer un poco al hombre detrás de la leyenda.

Algo similar ocurrió cuando cené en la playa, ese mismo día, con el legendario inversor Vinod Khosla.

Conferencia Medicina Exponencial San Diego día 3

El lunes 10 de octubre fur el tercer día de la Conferencia Medicina Exponencial San Diego.

Para mí lo más destacable fue:

Innovación Atrevida: Peter Diamandis, MD Co-Founder, Singularity University and Founder & Chair, XPRIZE

Rediseñando el Cuidado: Tony Young, PhD FRCS National Clinical Director for Innovation, NHS England

Bakul Patel, MBA Associate Director of Digital Health, Food and Drug Administration/Center for Devices and Radiological Health

Sacarse la foto de grupo xMED en la playa, con un dron muy chulo:

El cerebro y más allá:

  • Divya Chander, MD PhD Anesthesiologist/Neuroscientist, Stanford University
  • Arshya Vahabzadeh, MD Psychiatrist, Harvard Medical School
  • Anthony Bossis, PhD Clinical Assistant Professor- Department of Psychiatry, NYU School of Medicine

Fuera del planeta, medicina remota: Scott Parazynski, MD Managing Director, Apogee Interests & 5 Time NASA Astronaut (Retired)

Riesgos a la seguridad y privacidad en sanidad (y qué hacer al respecto): Marc Goodman, Resident futurologist at the FBI, Policy Law and Ethics Faculty Chair, Singularity University and Founder, FutureCrimes

El día culminó con una cena en la playa, y una fiesta en la playa con hoguera y un círculo de percusión.

Premio y Conferencia Medicina Exponencial San Diego día 2

El domingo 9 de octubre fue el segundo día de la Conferencia Medicina Exponencial en San Diego.

Algunas de las charlas más destacables fueron:

De ‘Omics a Acción

  • Moira Gunn, PhD Host, NPR’s Biotech Nation
  • Larry Smarr, PhD Professor, UCSD and Director, Calit2
  • George Poste, DVM PhD FRS Chief Scientist, Complex Adaptive Systems Initiative- Arizona State University

Salud Móvil, Conectada, Digital

  • David Albert, MD Founder, AliveCor
  • Stanley Shaw, MD PhD Co-Director, MGH Center for Assessment Technology & Continuous Health
  • Bakul Patel, MBA Associate Director of Digital Health, Food and Drug Administration/Center for Devices and Radiological Health
  • Ulrik Wisløff Professor: Faculty of Medicine, Norwegian University of Science and Technology

Innovando a Escala: John Mattison, MD CMIO and Assistant Medical Director, Kaiser Permanente

Conectando los Puntos: Mark Hyman, MD Chairman, Institute for Functional Medicine

El Futuro de de la Intervención

  • Catherine Mohr, MD Vice President of Strategy, Intuitive Surgical
  • Tippi MacKenzie, MD Professor of Pediatric Surgery, UCSF
  • Amir Szold, MD Chairman, Technology Committee: European Society for Endoscopic Surgery
  • Olivia Hallisey Grand Prize Winner, 2015 Google Science Fair

Transformando la Práctica Clínica: Todd Huffman Founder & CEO, 3Scan

El Futuro del Cáncer

  • Marty Tenenbaum, PhD Founder, Cancer Commons and Chairman & Founder/Chairman, CommerceNet
  • Sangeeta Bhatia, MD PhD, Director of Laboratory for Multiscale Regenerative Technologies, MIT
  • David Roberts, MBA, Former Special Agent, Business and Technology Disruption Expert

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La otra cosa interesante que ocurrió el segundo día es que recibí un premio: el Premio de Impacto en Medicina de Precisión lanzado por la Iniciativa por la Medicina de Precisión de la Casa Blanca y otorgado por el Estado de California, presentado por Elizabeth Baca, MD MPA, de la Oficina del Gobernador de California.

Esta noticia fue publicada a toda página por el suplemento Innovadores del diario El Mundo.
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